PipeBio

PipeBio 是什麼？

PipeBio是一個面向科學家和生物資訊學家的無程式碼、基於雲端的平臺，旨在加速抗體、TCR和胜肽的探索和工程。它提供全面的工具套件，用於大規模序列分析、註解、聚類和視覺化，支援高效的資料管理和流線型工作流程。該平臺與ELN、LIMS和內部工具無縫整合，並提供強大的REST API用於構建自動化流程。PipeBio使用戶能夠在安全協作的環境中分析NGS和Sanger資料，識別候選序列，評估可開發性，並優化抗體工程。

主要功能

• 全方位序列分析

  分析BCR、TCR、VHH、scFv和胜肽序列，提供註解、聚類和突變檢測工具。

• 自動化工作流程配置

  為抗體和胜肽探索設置端對端工作流程和標準操作程序，與ELN和LIMS系統整合。

• 集中化資料管理

  在中央資料庫中儲存序列及相關元資料，實現跨實驗和公共資料集的比較。

• 互動式視覺化工具

  透過互動式圖表視覺化序列聚類、胺基酸頻率、系統發育關係和富集分析。

• REST API整合

  透過強大的API以程式化方式上傳、下載和管理資料，構建自動化分析流程。

• 抗體工程工具

  編輯序列、優化密碼子合成、評估蛋白質特性，並分析可開發性和結構缺陷。

使用案例

• 抗體探索與篩選 : 加速從大規模NGS和雜交瘤資料集中識別候選抗體。
• 治療性工程 : 優化抗體和胜肽序列的可開發性和可製造性。
• 生物資訊工作流程自動化 : 自動化常規序列分析任務，並與更廣泛的研發資料生態系統整合。
• 資料視覺化和報告 : 為序列多樣性、克隆擴增和富集分析生成互動式視覺化和報告。
• 協作研究 : 實現研究團隊和組織之間的無縫資料共享和協作。

常見問題