PipeBio

Что такое PipeBio?

PipeBio — это облачная платформа без кода, разработанная для ученых и биоинформатиков для ускорения открытия и конструирования антител, TCR и пептидов. Она предоставляет комплексный набор инструментов для крупномасштабного анализа последовательностей, аннотирования, кластеризации и визуализации, поддерживая эффективное управление данными и оптимизированные рабочие процессы. Платформа беспрепятственно интегрируется с ELN, LIMS и внутренними инструментами, а также предлагает надежный REST API для создания автоматизированных конвейеров. PipeBio позволяет пользователям анализировать данные NGS и Sanger, идентифицировать кандидатные последовательности, оценивать возможности разработки и оптимизировать конструирование антител, всё в безопасной и совместной среде.

Ключевые функции

• Комплексный анализ последовательностей

  Анализируйте последовательности BCR, TCR, VHH, scFv и пептидов с помощью инструментов для аннотирования, кластеризации и обнаружения мутаций.

• Автоматизированная настройка рабочих процессов

  Настраивайте сквозные рабочие процессы и стандартные операционные процедуры для открытия антител и пептидов с интеграцией в системы ELN и LIMS.

• Централизованное управление данными

  Храните последовательности и связанные метаданные в центральной базе данных, что позволяет сравнивать эксперименты и публичные наборы данных.

• Интерактивные инструменты визуализации

  Визуализируйте кластеры последовательностей, частоты аминокислот, филогенетические отношения и анализ обогащения с помощью интерактивных диаграмм.

• Интеграция REST API

  Программно загружайте, скачивайте и управляйте данными, а также создавайте автоматизированные конвейеры анализа с помощью надежного API.

• Инструменты для конструирования антител

  Редактируйте последовательности, оптимизируйте кодоны для синтеза, оценивайте свойства белков и анализируйте возможности разработки и структурные недостатки.

Варианты использования

• Открытие и скрининг антител : Ускорьте идентификацию кандидатных антител из крупномасштабных наборов данных NGS и гибридом.
• Инженерия терапевтических средств : Оптимизируйте последовательности антител и пептидов для возможности разработки и производства.
• Автоматизация биоинформатических рабочих процессов : Автоматизируйте рутинные задачи анализа последовательностей и интегрируйтесь с более широкими экосистемами данных R&D.
• Визуализация данных и отчетность : Создавайте интерактивные визуализации и отчеты для анализа разнообразия последовательностей, клональной экспансии и обогащения.
• Совместные исследования : Обеспечьте беспрепятственный обмен данными и сотрудничество между исследовательскими группами и организациями.

Часто задаваемые вопросы