PipeBio

Was ist PipeBio?

PipeBio ist eine No-Code-, Cloud-basierte Plattform, die für Wissenschaftler und Bioinformatiker entwickelt wurde, um die Entdeckung und das Engineering von Antikörpern, TCRs und Peptiden zu beschleunigen. Sie bietet eine umfassende Suite von Tools für die groß angelegte Sequenzanalyse, Annotation, Clustering und Visualisierung, unterstützt effizientes Datenmanagement und optimierte Workflows. Die Plattform integriert sich nahtlos mit ELN, LIMS und internen Tools und bietet eine robuste REST-API für den Aufbau automatisierter Pipelines. PipeBio ermöglicht es Benutzern, NGS- und Sanger-Daten zu analysieren, Kandidatensequenzen zu identifizieren, die Entwicklungsfähigkeit zu bewerten und das Antikörper-Engineering zu optimieren, alles in einer sicheren und kollaborativen Umgebung.

Hauptfunktionen

• Umfassende Sequenzanalyse

  Analysieren Sie BCR-, TCR-, VHH-, scFv- und Peptidsequenzen mit Tools für Annotation, Clustering und Mutationserkennung.

• Automatisierte Workflow-Konfiguration

  Richten Sie End-to-End-Workflows und Standardbetriebsverfahren für die Entdeckung von Antikörpern und Peptiden ein, mit Integration in ELN- und LIMS-Systeme.

• Zentralisiertes Datenmanagement

  Speichern Sie Sequenzen und zugehörige Metadaten in einer zentralen Datenbank, um Vergleiche zwischen Experimenten und öffentlichen Datensätzen zu ermöglichen.

• Interaktive Visualisierungstools

  Visualisieren Sie Sequenzcluster, Aminosäurehäufigkeiten, phylogenetische Beziehungen und Anreicherungsanalysen mit interaktiven Diagrammen.

• REST-API-Integration

  Laden Sie Daten programmgesteuert hoch, herunter und verwalten Sie sie, und erstellen Sie automatisierte Analysepipelines über eine robuste API.

• Antikörper-Engineering-Tools

  Bearbeiten Sie Sequenzen, optimieren Sie Codons für die Synthese, bewerten Sie Proteineigenschaften und analysieren Sie Entwicklungsfähigkeit und strukturelle Schwachstellen.

Anwendungsfälle

• Antikörperentdeckung und -screening : Beschleunigen Sie die Identifizierung von Kandidatenantikörpern aus umfangreichen NGS- und Hybridom-Datensätzen.
• Therapeutisches Engineering : Optimieren Sie Antikörper- und Peptidsequenzen für Entwicklungsfähigkeit und Herstellbarkeit.
• Bioinformatik-Workflow-Automatisierung : Automatisieren Sie routinemäßige Sequenzanalyseaufgaben und integrieren Sie sie in breitere F&E-Datenökosysteme.
• Datenvisualisierung und Berichterstattung : Erstellen Sie interaktive Visualisierungen und Berichte für Sequenzdiversität, klonale Expansion und Anreicherungsanalyse.
• Kollaborative Forschung : Ermöglichen Sie nahtlosen Datenaustausch und Zusammenarbeit zwischen Forschungsteams und Organisationen.

Häufig gestellte Fragen