PipeBio

O que é PipeBio?

PipeBio é uma plataforma baseada em nuvem sem código projetada para cientistas e bioinformatas para acelerar a descoberta e engenharia de anticorpos, TCRs e peptídeos. Ela oferece um conjunto abrangente de ferramentas para análise, anotação, agrupamento e visualização de sequências em larga escala, suportando gerenciamento eficiente de dados e fluxos de trabalho otimizados. A plataforma se integra perfeitamente com ELN, LIMS e ferramentas internas, e oferece uma API REST robusta para construção de pipelines automatizados. PipeBio permite aos usuários analisar dados de NGS e Sanger, identificar sequências candidatas, avaliar capacidade de desenvolvimento e otimizar a engenharia de anticorpos, tudo em um ambiente seguro e colaborativo.

Recursos Principais

• Análise Abrangente de Sequências

  Analise sequências de BCR, TCR, VHH, scFv e peptídeos com ferramentas para anotação, agrupamento e detecção de mutações.

• Configuração Automatizada de Fluxos de Trabalho

  Configure fluxos de trabalho de ponta a ponta e procedimentos operacionais padrão para descoberta de anticorpos e peptídeos, com integração a sistemas ELN e LIMS.

• Gerenciamento Centralizado de Dados

  Armazene sequências e metadados associados em um banco de dados central, permitindo comparação entre experimentos e conjuntos de dados públicos.

• Ferramentas Interativas de Visualização

  Visualize agrupamentos de sequências, frequências de aminoácidos, relações filogenéticas e análise de enriquecimento com gráficos interativos.

• Integração com API REST

  Faça upload, download e gerencie dados programaticamente, e construa pipelines de análise automatizados através de uma API robusta.

• Ferramentas de Engenharia de Anticorpos

  Edite sequências, otimize códons para síntese, avalie propriedades de proteínas e analise capacidade de desenvolvimento e limitações estruturais.

Casos de Uso

• Descoberta e Triagem de Anticorpos : Acelere a identificação de anticorpos candidatos a partir de conjuntos de dados de NGS e hibridomas em larga escala.
• Engenharia Terapêutica : Otimize sequências de anticorpos e peptídeos para capacidade de desenvolvimento e fabricação.
• Automação de Fluxos de Trabalho de Bioinformática : Automatize tarefas rotineiras de análise de sequências e integre com ecossistemas de dados de P&D mais amplos.
• Visualização de Dados e Relatórios : Gere visualizações interativas e relatórios para análise de diversidade de sequências, expansão clonal e enriquecimento.
• Pesquisa Colaborativa : Possibilite o compartilhamento de dados e colaboração perfeitos entre equipes de pesquisa e organizações.

Perguntas Frequentes