PipeBio

什么是PipeBio？

PipeBio是一个面向科学家和生物信息学家的无代码、基于云的平台，旨在加速抗体、TCR和肽段的发现和工程。它提供全面的工具套件，用于大规模序列分析、注释、聚类和可视化，支持高效的数据管理和流线型工作流。该平台与ELN、LIMS和内部工具无缝集成，并提供强大的REST API用于构建自动化流程。PipeBio使用户能够在安全协作的环境中分析NGS和Sanger数据，识别候选序列，评估可开发性，并优化抗体工程。

主要功能

• 全面的序列分析

  分析BCR、TCR、VHH、scFv和肽段序列，提供注释、聚类和突变检测工具。

• 自动化工作流配置

  为抗体和肽段发现设置端到端工作流和标准操作流程，与ELN和LIMS系统集成。

• 集中化数据管理

  在中央数据库中存储序列及相关元数据，实现跨实验和公共数据集的比较。

• 交互式可视化工具

  通过交互式图表可视化序列聚类、氨基酸频率、系统发育关系和富集分析。

• REST API集成

  通过强大的API以编程方式上传、下载和管理数据，构建自动化分析流程。

• 抗体工程工具

  编辑序列、优化密码子合成、评估蛋白质特性，并分析可开发性和结构缺陷。

使用场景

• 抗体发现与筛选 : 加速从大规模NGS和杂交瘤数据集中识别候选抗体。
• 治疗性工程 : 优化抗体和肽段序列的可开发性和可制造性。
• 生物信息学工作流自动化 : 自动化常规序列分析任务，并与更广泛的研发数据生态系统集成。
• 数据可视化和报告 : 为序列多样性、克隆扩增和富集分析生成交互式可视化和报告。
• 协作研究 : 实现研究团队和组织之间的无缝数据共享和协作。

常见问题