PipeBio

PipeBioとは？

PipeBioは、抗体、TCR、ペプチドの発見とエンジニアリングを加速するために科学者とバイオインフォマティシャンのために設計されたノーコードのクラウドベースプラットフォームです。大規模な配列分析、注釈付け、クラスタリング、可視化のための包括的なツールスイートを提供し、効率的なデータ管理と合理化されたワークフローをサポートします。このプラットフォームはELN、LIMS、内部ツールとシームレスに統合し、自動化されたパイプラインを構築するための強力なREST APIを提供します。PipeBioを使用すると、安全で協力的な環境でNGSおよびSangerデータを分析し、候補配列を特定し、開発可能性を評価し、抗体エンジニアリングを最適化することができます。

主な機能

• 包括的な配列解析

  BCR、TCR、VHH、scFv、ペプチド配列を注釈付け、クラスタリング、突然変異検出ツールで分析します。

• 自動化されたワークフロー構成

  抗体およびペプチド発見のためのエンドツーエンドのワークフローと標準操作手順を設定し、ELNおよびLIMSシステムと統合します。

• 集中データ管理

  配列と関連メタデータを中央データベースに保存し、実験間および公開データセット間の比較を可能にします。

• インタラクティブな可視化ツール

  インタラクティブなチャートで配列クラスター、アミノ酸頻度、系統発生関係、エンリッチメント分析を可視化します。

• REST API統合

  強力なAPIを通じてプログラム的にデータのアップロード、ダウンロード、管理を行い、自動化された分析パイプラインを構築します。

• 抗体エンジニアリングツール

  配列の編集、合成のためのコドン最適化、タンパク質特性の評価、開発可能性と構造的な問題の分析を行います。

ユースケース

• 抗体の発見とスクリーニング : 大規模NGSおよびハイブリドーマデータセットからの候補抗体の特定を加速します。
• 治療用エンジニアリング : 抗体およびペプチド配列の開発可能性と製造可能性を最適化します。
• バイオインフォマティクスワークフロー自動化 : 日常的な配列分析タスクを自動化し、より広範なR&Dデータエコシステムと統合します。
• データ可視化とレポート : 配列多様性、クローン拡大、エンリッチメント分析のためのインタラクティブな可視化とレポートを生成します。
• 共同研究 : 研究チームと組織間でのシームレスなデータ共有とコラボレーションを可能にします。

よくある質問