PipeBio

Qu'est-ce que PipeBio ?

PipeBio est une plateforme cloud sans code conçue pour les scientifiques et les bioinformaticiens afin d'accélérer la découverte et l'ingénierie d'anticorps, de TCR et de peptides. Elle fournit une suite complète d'outils pour l'analyse, l'annotation, le regroupement et la visualisation de séquences à grande échelle, soutenant une gestion efficace des données et des flux de travail rationalisés. La plateforme s'intègre parfaitement avec les ELN, LIMS et outils internes, et offre une API REST robuste pour créer des pipelines automatisés. PipeBio permet aux utilisateurs d'analyser les données NGS et Sanger, d'identifier les séquences candidates, d'évaluer la développabilité et d'optimiser l'ingénierie des anticorps, le tout dans un environnement sécurisé et collaboratif.

Fonctionnalités clés

• Analyse complète des séquences

  Analysez les séquences BCR, TCR, VHH, scFv et peptidiques avec des outils d'annotation, de regroupement et de détection de mutations.

• Configuration automatisée des flux de travail

  Établissez des flux de travail de bout en bout et des procédures opérationnelles normalisées pour la découverte d'anticorps et de peptides, avec intégration aux systèmes ELN et LIMS.

• Gestion centralisée des données

  Stockez les séquences et les métadonnées associées dans une base de données centrale, permettant la comparaison entre expériences et jeux de données publics.

• Outils de visualisation interactifs

  Visualisez les clusters de séquences, les fréquences d'acides aminés, les relations phylogénétiques et l'analyse d'enrichissement avec des graphiques interactifs.

• Intégration API REST

  Téléchargez, téléversez et gérez des données par programmation, et créez des pipelines d'analyse automatisés grâce à une API robuste.

• Outils d'ingénierie des anticorps

  Éditez des séquences, optimisez les codons pour la synthèse, évaluez les propriétés des protéines et analysez la développabilité et les responsabilités structurelles.

Cas d'utilisation

• Découverte et criblage d'anticorps : Accélérez l'identification des anticorps candidats à partir de grands ensembles de données NGS et d'hybridomes.
• Ingénierie thérapeutique : Optimisez les séquences d'anticorps et de peptides pour la développabilité et la fabricabilité.
• Automatisation des flux de travail bioinformatiques : Automatisez les tâches d'analyse de séquences de routine et intégrez-les aux écosystèmes de données R&D plus larges.
• Visualisation des données et rapports : Générez des visualisations interactives et des rapports pour la diversité des séquences, l'expansion clonale et l'analyse d'enrichissement.
• Recherche collaborative : Permettez un partage de données et une collaboration fluides entre les équipes de recherche et les organisations.

FAQ